Guitar Pro 6 se différencie de Guitar Pro 5 au niveau de la gestion des pistes et de la notation musicale. Les instruments fretless tels que la batterie ou le piano sont désormais associés à une forme de notation qui ne peut être modifiée suite à la création de la piste.
Si vous souhaitez par exemple transcrire une piste de piano en tablature, il est nécessaire de créer une nouvelle piste de type guitare et de copier/coller le contenu de la piste piano pour l'afficher dans sa forme tablature.